A LIGA SANJOANENSE DE DESPORTOS, foi fundada em 02 de junho de 1953, teve sua origem na antiga Liga Sanjoanense de Futebol, que por sua vez teve sua origem na Comissão Municipal Extra de Futebol, que iniciou suas atividades em 27 de junho de 1947. Foi seu fundador o Sr. Francisco Pedro Regini.

A Comissão Extra de Futebol fez realizar campeonatos de futebol, nos anos de 1947 a 1952. A partir de 1953, o Campeonato passou a ser realizado pela LIGA, natural sucessora da referida Comissão, conforme ata de fundação, de termos seguintes:

"Aos dois de junho de 1953, nesta cidade de São João da Boa Vista, Estado de São Paulo, às 20,30 horas, no prédio na rua Governador Armando Sales, onde presente se achava o Presidente da Comissão Extra Municipal de Futebol, comigo 1o Secretário ao fim assinado. Aí presente o ser. Newton da Costa Patrão, Presidente da Comissão Municipal de Esportes, ser. Presidente do Harmônicas, todos os diretores, com exceção do Secretário Geral, Tesoureiro Geral e 1o Tesoureiro, que se encontram ausentes, por motivo de doença. Estando também presentes todos os representantes dos clubes, com exceção do Jardim Santo André. Pelo sr. Presidente foi aberta a sessão, comunicando que a finalidade da mesma era a transformação da Comissão Extra para LIGA SANJOANENSE DE FUTEBOL. Pelo sr. Presidente foi dito, dirigindo-se aos representantes, quais as vantagens da transformação desta Comissão para Liga Sanjoanense de Futebol, palavras essas que foram endossadas pelo sr. Presidente da Comissão Municipal de Esportes. Pelos representantes dos clubes foi dito que estavam de pleno acordo com essa transformação desde que fosse para o bem do futebol de São João da Boa Vista, sendo então aprovada unanimamente a fundação da LIGA SANJOANENSE DE FUTEBOL. Nada mais havendo o sr. Presidente, em aditamento , pos em votação o rascunho dos estatutos da Liga Sanjoanense de Futebol, o qual foi aceito tal como se acha redigido, e aprovado. Do que lavrei esta, que depois de lida e achada conforme, vai devidamente assinada. Eu Milton Gianelli, 1o Secretário a escrevi. João Batista de Barros - Presidente. Newton da Costa Patrão - Presidente da C.M.F.. Alcides Soares, Vicente Labatte - 1o e 2o Vice-presidentes. Thomaz Nora Filho - 2o Secretário. Milton Hilário Silva - 2o Tesoureiro. Gabriel de Oliveira Westim - Chefe do Depto. de Árbitros. Representantes dos Clubes:  pelo C.D. São Lázaro - Ângelo Esteves. pela Harmônicas F.C. - José Simões. pelo Juventus F.C. - Orlando Farnetani. pelo D.E.R. Futebol Clube - Pedro Mansi. pela A.A. Ponte Preta - João Camilo. pelo Pratinha F.C. - Amado Valentim Lopes. pelo Jabaquara A.C. - João Boaventura Filho. pelo Comerciários F.C. -  Aluizio Marçal de Barros. pelo Palmeirinhas F.C. - Agenor Adolfo de Lima. pelo C.A. Ipiranga - Júlio Alves Pinto, convidado - Presidente do Harmônicas Sartorello - Vicente B. Andrighotto."

Em 1954, após a organização da LIGA SANJOANENSE DE FUTEBOL, foi eleita sua primeira diretoria, sob a presidência do sr. José Luís Catani tendo como membros os seguintes cidadãos: Alcides Soares, 1o Vice Presidente; Vicente Lobatte, 2o Vice Presidente; Dr. Alfredo Naor Rodrigues, Secretário Geral; Petronilho Petroni, 1o Secretário; Alcide M. Torres, 2o Secretário; Laercio Guimarães, 1o Tesoureiro; Romildo Alonso, 2o Tesoureiro; Gabriel Oliveira Westim, Diretor do Departamento de Árbitros; e, Elias Assad Simão, Celso Noronha, Dino Renan Gianelli, Américo Carneiro, Jarim Carneiro, Juvêncio dos Santos e José da Costa, árbitros.

Em 2001, com a mudança dos Estatutos, a Liga Sanjoanense de Futebol, passou a chamar-se LIGA SANJOANENSE DE DESPORTOS, atualmente a Liga organiza um dos Campeonatos mais fortes da Região, com a participação de mais de 30 clubes nos dois campeoantos amadores que organiza anualmente. A Liga também organiza Campeonatos da Categoria de Base e Campeoantos de Veteranos.